新一季的剧情在巴拿马索纳监狱(SONA)展开，这里关押的尽是穷凶极恶之徒，法律没有效力，Lechero，一个狡猾的毒贩是这些恶徒们的首领。初来乍到，自然要拜过山头，迈克尔和马宏以及一干新进人犯被带去见Lechero，他早就对迈克尔的所作所为有所耳闻，并对他表现出极大敌意。马宏对迈克尔示好，并提出要求一同逃出监狱，但却被迈克尔拒绝，同时，他们俩也见到了老伙伴--T-Bag，各路“好汉”再次聚首。　同样被投入监狱的前狱警贝利克则过着残不忍睹的生活，没有食物，衣不遮体，还要被迫打扫厕所。但在那里他见到了一个神秘人物韦斯勒(Whistler)，他要求贝利克为他做一件事情，并许以食物相换。

　　监狱里的争端有一个特定的方法解决--“鸡爪子”，即双方生死相搏，迈克尔被陷害，与一黑大汉相斗。这时，贝利克出现，并把韦斯勒给他的2张字条塞给搏斗的两人。在马宏的帮助下，迈克尔赢得了生死之斗，而黑大汉的死尸被抬出监狱，等候在那里的女子索菲亚(Sofia)打开字条，上面赫然写着一串数字和词语。

　　监狱外，林肯一方面竭力寻找办法救迈克尔出来，一方面也寻找莎拉和儿子LJ。偶然间，他竟接到LJ的电话，告知自己也到了巴拿马，并且要见林肯。林肯赶到相约地点，见到的却是一个陌生女子，并且得知莎拉和LJ被绑架，只有把一个叫做韦斯勒的男子弄出索纳监狱，才可以拯救莎拉，LJ和迈克尔。林肯与迈克尔见面，并且把这个事情告诉了他。 (西风/文)